Практическая Молекулярная Биология - главная страница.
 > Расчёты > Трансляция.

Трансляция нуклеотидной последовательности.

       Название (не обязательно):  
       Нуклеотидная последовательность без названия:
    (регистр значения не имеет, игнорируются любые знаки, кроме: agctuswrymkhbdvn)


       

       Нуклеотидная последовательность:
       выводить по нуклеотидов в строке;
       вывести исходную последовательность;
       вывести комплементарную последовательность в 5' --> 3' направлении;

       Трансляция нуклеотидной последовательности:
       выводить по аминокислот в строке, код:  
       транслировать в следующих рамках считывания:
        +1;     +2;     +3;     все
        -1;     -2;     -3;    


       Выравнивание:
       выровнять аминокислотные последовательности относительно нуклеотидной.


    Форма проводит трансляцию нуклеотидной последовательности в выбранных рамках считывания. Можно выбирать несколько рамок одновременно.

    Если нужно найти редкие кодоны, то лучше использовать форму "Поиск редких кодонов в кодирующей последовательности" (кстати, она выдаёт пронумерованные последовательности). Различные манипуляции с нуклеотидной последовательностью (чтение в обратную сторону, чтение комплементарной, перевод в двухцепочечную) можно выполнить с помощью специальной формы.

    Стандартные обозначения полиморфных позиций:

    СимволОбозначаетОбъяснение
    RA или GpuRine
    YC или TpYrimidine
    MA или CaMino
    KG или TKeto
    SC или Gсильное /Strong/ взаимодействие - три
    водородные связи
    WA или Tслабое /Weak/ взаимодействие - две
    водородные связи
    H(A, C, T) но не GH следует за G в алфавите
    B(C, G, T) но не AB следует за A в алфавите
    V(A, C, G) но не T(U)V следует за T(U) в алфавите
    D(A, G, T) но не CD следует за C в алфавите
    N(A, G, C, T)любое основание / Nucleotide


    NB: Для работы программы на броузере должно быть включена опция JavaScript.


"Практическая Молекулярная Биология" http://molbiol.edu.ru
e-mail: pmb@molbiol.edu.ru


Rambler's Top100