Практическая Молекулярная Биология - главная страница.
 > Расчёты > Простые преобразования нукл. последовательности.

Операции с нуклеотидной последовательностью.

       Название (не обязательно):  
       Нуклеотидная последовательность без названия:
    (регистр значения не имеет, игнорируются любые знаки, кроме: agctuswrymkhbdvn)


       

       выводить по нуклеотидов в строке;
       вывести исходную последовательность;
       прочитать последовательность в обратном направлении;
       прочитать комплементарную последовательность в 5' --> 3' направлении;
       прочитать комплементарную последовательность в 3' --> 5' направлении.
       вывести двухцепочечную последовательность.


    NB: Для работы программы на броузере должно быть включена опция JavaScript.

    Форма проводит простейшие манипуляции с нуклеотидной последовательностью. Можно проводить как одиночные преобразования, так и несколько преобразований за раз.

    Чтобы транслировать последовательность можно воспользоваться формой "Трансляция нуклеотидной последовательности". Если нужно найти редкие кодоны, то лучше использовать форму "Поиск редких кодонов в кодирующей последовательности" (кстати, она выдаёт пронумерованные последовательности).


    Стандартные обозначения полиморфных позиций:

    СимволОбозначаетОбъяснение
    RA или GpuRine
    YC или TpYrimidine
    MA или CaMino
    KG или TKeto
    SC или Gсильное /Strong/ взаимодействие - три
    водородные связи
    WA или Tслабое /Weak/ взаимодействие - две
    водородные связи
    H(A, C, T) но не GH следует за G в алфавите
    B(C, G, T) но не AB следует за A в алфавите
    V(A, C, G) но не T(U)V следует за T(U) в алфавите
    D(A, G, T) но не CD следует за C в алфавите
    N(A, G, C, T)любое основание / Nucleotide

"Практическая Молекулярная Биология" http://molbiol.edu.ru
e-mail: pmb@molbiol.edu.ru


Rambler's Top100