Программа Visual Cloning 2000 позволяет строить геномные карты не только на основе нуклеотидных последовательностей и соответствующих априорных знаний, но и на основе информации из интернет, благодаря возможностям импорта данных.

Попробуем получить из Интернет карту уже известной нам плазмиды pBR322 и сравнить ее с картой, которую мы построили сами.

Нужно подключиться к Интернет, и затем запустить Visual Cloning. Нажмем кнопку "Internet" на вертикальной панели программы. Если у нас уже есть соединение с Интернет, то во встроенном браузере программы появится стартовая страница ResearchNet компании Redasoft.

Кликнем на ссылке "National Center for Biotechnology Information". В браузер будет загружена главная страница NCBI. (В целях сокращения физического размера материалов мы будем показывать только верхнюю часть страницы там, где это возможно).

Перейдем на страницу базы данных Entrez. В раскрывающемся списке после слова Search выберем опцию Nucleotide, а в строке поиска запишем "Cloning vector pBR322, complete genome" и нажмем на кнопку GO.

Если мы нигде не ошиблись, то результат поиска будет всего один – запись с кодом J01749 – это описание искомой последовательности, кликнем на ссылке и получим это описание.

Убедимся, что это то, что нам нужно и нажмем на клавишу "Import" на верхней панели инструментов VC. Появится окно мастера создания новой карты, где нужно нажать на клавишу "Готово". Программа построит нам карту.

Видно, что схема перегружена деталями, поэтому удалим некоторые маркеры (главным образом, misc_binding и misc_feature).

Видно, что геномная карта, описание которой импортировано из Интернет, в значительной степени соответствует карте, построенной на основе "чистой" последовательности.