на главную страницу
 > Обзоры > Биологические Web ресурсы.

Молекулярно-биологические ресурсы.


    Профессиональные ресурсы.

    NAR database

    Ежегодно первый номер журнала "Nucleic Acid Research" посвящён обзору молекулярно-биологических баз данных. Обзорную статью этого номера и сортированные (по темам и по алфавиту) списки баз данных в HTML формате можно найти на сайте журнала (кнопка "NAR database issue").

    BioMedNet

    BioMedNet организован Elsevier Science. Это web-сайт для биологов и медиков. На сегодняшний день он имеет более 600,000 зарегистрированных пользователей (эта цифра увеличивается ежемесячно на более чем 20,000). Регистрация и весь сайт бесплатные. Можно получать новости сайта по E-mail.

    * Публикуются обзоры, новости, обзоры конференций;
    * Хорошая подборка аннотированных web-ресурсов;
    * Список журналов со свободным доступом (часто временно/ради рекламы доступны хорошие журналы), возможность подписаться на "содержание журналов";
    * Возможность поиска фирм производителей конкретной медико-биологической продукции;
    * Имеются: medline; Technical Tips (коллекция мол. биол. протоколов);
    * База вакансий с возможностью поиска.

    Medscape Molecular Medicine

    Аналогичный описанному выше ресурс (только для медиков) организованный MedicaLogic/Medscape, Inc. На сегодняшний день он имеет более миллиона зарегистрированных пользователей. Можно получать новости сайта по E-mail. Множество полезных ресурсов и ссылок.

    Научные конференции

    Пока лучший известный нам источник информации о научных конференциях – раздел "Научные конференции" на сайте "Научная инициатива в Интернет".

    Патенты.

    Два "постоянных" бесплатных адреса и один - теперь уже платный (раньше была бета-тест программа но хорошая).

    IBM Patent Server

    IBM Intellectual Property Network (IPN). Позволяет искать и просматривать патентные документы. Обеспечивает доступ к:

    * United States patents (US). 1971 - до настоящего времени, еженедельное обновление. Полный текст с картинками. От U.S. Patent and Trademark Office.
    * European patents - applications (EP-A). 1979 - до настоящего времени, еженедельное обновление. Библиографический текст с картинками. От European Patent Office; Vienna, Austria
    * European patents - issued (EP-B). 1980 - до настоящего времени, еженедельное обновление. Библиографический текст с картинками. От European Patent Office; Vienna, Austria.
    * Patent Abstracts of Japan (JP). 10/1976- до настоящего времени, еженедельное обновление. Библиографический текст, первая страница. От JAPIO, Japan Patent Information Organization; Toyko, Japan.
    * IBM Technical Disclosure Bulletins.

    Картинки приходят в "*.pdf" формате, причём их качество обычно весьма плохое.

    United States Patent and Trademark Office

    Архив содержит все патенты США (только США) с 1976г. Картинки приходят в "*.tif" формате. Для того, чтобы их смотреть надо установить соответствующий plug-in. Список бесплатных источников находится на этом же сайте.

    GetthePatent.com

    GetthePatent.com организован Cartesian Products, Inc (компания, специализирующаяся в области телекоммуникации и предоставления информации). Архив содержит все патенты США (только США) с 1976г. В настоящее время закончилось бета-тестирование и надо платить. Есть возможность получать файлы по E-mail, а не ждать их загрузки в он-лайн режиме.

    Документы приходят с расширением *.cpc. Для их просмотра требуется установить plug-in "CPC Lite" от Cartesian Products. Его можно бесплатно скачать с сайта фирмы-производителя.

    Наиболее удобный и быстрый (но теперь уже не бесплатный) способ получения текстов патентов.

    Литература.

    Журналы.

    Более 4000 ссылок на биологические и медицинские журналы содержится на "science.komm" (там же удобные ссылки на полнотекстовые источники, словари, базы данных по абстрактам и т.п.). По web-ссылке вы попадаете на сайт конкретного журнала. На многих журналах можно подписаться на рассылку оглавления по E-mail.

    Ссылки.

    Citation Matcher. Организован National Center for Biotechnology Information (NCBI) National Institutes of Health (NIH). Позволяет найти статью по библиографическим данным. Возможен поиск сразу же большого количества статей. Можно использовать Citation Matcher через E-mail (E-Mail Citation Matcher); чтобы узнать правила работы достаточно послать письмо с текстом HELP.

    Импакт-фактор.

    Импакт-фактор журналов можно найти на сайте Journal Citation Reports on the Web (JCR Web). На этом сайте представлены данные по цитированию более 8,400 журналов более чем 3,000 издательств.

    Список импакт-факторов биологических журналов за 1999г. имеется на нашем сервере.

    Книги.

    Получить информацию о книге/аудио/видео/DVD/ (или заказать) можно на сайте "Amazon.com". 4.7 миллионов названий.

    Опубликована on line версия книги Benjamin Lewin "Genes". Она основана на тех же материалах, что и печатная версия, но в отличии от неё непрерывно обновляется. Наиболее свежая печатная версия - 7е издание, вышла в январе 2000.

    Базы данных по абстрактам.

    PubMed. Организован National Center for Biotechnology Information (NCBI) National Institutes of Health (NIH). PubMed содержит полное содержание MEDLINE и PREMEDLINE баз данных и некоторые статьи не входящие в них. Очень удобно доверить регулярный просмотр ссылок на PubMed программе BioMail.

    Medline на уже упоминавшемся "BioMedNet".
    Medline на "HealthWord Online".
    Medline на "Medscape Molecular Medicine".
    Другие источники можно найти на "science.komm".

    Модельные организмы.

    Arabidopsis.

    TAIR: совместный проект Carnegie Institution of Washington Department of Plant Biology и National Center for Genome Resources (NCGR).

    AIMS: совместный проект Michigan State University и Arabidopsis Biological Resource Center (ABRC) Ohio State University финансируемый NSF. ARABIDOPSIS INFORMATION MANAGEMENT SYSTEM и ARABIDOPSIS BIOLOGICAL RESOURCE CENTER

    AFGC - Arabidopsis Functional Genomics Consortium: совместный проект четырёх университетов по изучению функции генов Arabidopsis, объединяющий Expression Microarray Analysis и T-DNA нокаут.

    Drosophila

    Flybase: информационная база данных по генетике и молекулярной биологии дрозофилы. Содержит литературные данные и данные из Drosophila Genome Projects. FlyBase – совместный проект Berkeley и European Drosophila Genome Projects.

    IUBio, Bloomington, Indiana USA
    Harvard, Cambridge, Mass USA
    E.B.I., Cambridge, UK
    B.D.G.P., Berkeley, California USA
    N.I.G., Japan
    NHRI, Taiwan
    ANGIS, Sydney, Australia
    I.B.M.C., Strasbourg, France
    Weizmann, Israel

    Mouse

    Мы не настолько хорошо знаем ресурсы, связанные с этим организмом, чтобы делать подробный обзор, но не можем не отметить пособие по препарированию мышей "Mickey: The Inside Story" на сайте National Cancer Institute.

    Сток-центры (культуры клеток и микроорганизмы).

    В сток-центрах можно приобрести штаммы и культуры (заказ на выращивание определённого количества клеток), заказать идентификацию микроорганизмов и т.п. На web-сайтах можно получить информацию об условиях роста, истории линии и ссылки на связанные с ней публикации.

    American Type Culture Collection (ATCC)

    German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ)

    По крайней мере для бактерий цены раза в два ниже, чем у "ATCC".

    Адреса других (в том числе и Российских) сток-центров можно найти на этой странице сайта University of California Museum of Paleontology (UCMP).

    Базы данных.

    GeneCards

    GeneCards: human genes, proteins and diseases. база данных человеческих генов, их продуктов и их участия в генетических заболеваниях. Полезна для тех, кто ищет информацию о генах в контексте функциональных геномных и протеомных проектов.

    Анализ нуклеотидных и белковых последовательностей.

    BCM Search Launcher

    Search Launcher организован Baylor College of Medicine. Сайт предоставляет возможность проводить различные молекулярно-биологические анализы/поиски со стандартного и очень простого интерфейса (реально серьёзные анализы проводятся на других серверах). На сервере можно выполнять простые преобразования последовательностей. Есть возможность организовать анализ сразу пачки последовательностей.

    Ресурс просто незаменим для тех, кто не чувствует себя большим мастером по анализу последовательностей.

    ExPASy Molecular Biology Server

    ExPASy (Expert Protein Analysis System) протеомик сервер Swiss Institute of Bioinformatics (SIB). Сервер предназначен для анализа белковых последовательностей, структур и 2-D PAGE.

    National Center for Biotechnology Information

    NCBI организован в 1988 как отделение National Library of Medicine(NLM) в National Institutes of Health (NIH). В настоящее время это крупнейшая биологическая база данных (молекулярная биология, биохимия и генетика). NCBI имеет мощные системы обработки и представления этих данных.

    По этому адресу имеется очень толковое описание ресурсов сайта.


"Практическая Молекулярная Биология" http://molbiol.edu.ru
e-mail: pmb@molbiol.edu.ru


Rambler's Top100