Практическая молекулярная биология

  Главная
  Программа "МКБ"
  Новости
  Справочник
  Рестриктазы
  Методы
  Растворы
  Расчеты
  Обзоры
  Обучение
  Ссылки
  Скачать сайт
  Написать письмо
  О проекте

English version

Практическая молекулярная биология

10.04.08 Программа МКБ. Окончательные результаты конкурса...
10.04.08 Программа МКБ. Результаты по Сибирскому отделению РАН...
28.03.08 Программа МКБ. Информация от экспертной комиссии №2...
24.03.08 Завершился конкурс по программе "Молекулярная и клеточная биология"...
14.03.08 Программа МКБ. Информация от экспертной комиссии №1...
15.02.08 Объявлен новый конкурс по программе "Молекулярная и клеточная биология"...
20.03.07 Программа отчетной конференции МКБ (2-11 апреля)...

10.04.08 Программа МКБ. Окончательные результаты конкурса...

Вся информация в этом Word файле.

10.04.08 Программа МКБ. Результаты по Сибирскому отделению РАН...

Таблица с результатами в этом Word файле.

28.03.08 Программа МКБ. Информация от Экспертной комиссии №2...

Вся информация в этом Word файле.

24.03.08 Завершился конкурс по программе "Молекулярная и клеточная биология"...

17 марта 2008 года завершился конкурс по Программе "Молекулярная и клеточная биология". С 1 марта по 17 марта 2008 года на конкурс поступило всего 24 проекта. Проведен обсчет всех поступивших проектов, результаты которого приводятся ниже. В настоящее время эти проекты проходят экспертизу. Списки победителей конкурса с учетом экспертной оценки будут опубликованы после 2 апреля 2008 года.

Все результаты в этом Word файле.

Справочник:

Единицы измерения.

Аминокислоты, белки.

Нуклеотиды, нуклеиновые кислоты.

Свойства и состав живых организмов.

Радиоизотопы и флуорофоры.

Центрифугирование.

Гибридизация.

Рестриктазы.

наверх

Методы:

Двугибридная система:

Экспресс метод выделения pDNA из дрожжей.

Анализ активации репортерного гена LacZ.

Трансформация дрожжей плазмидной ДНК.

Выделение плазмидной ДНК из дрожжей на колонках.

Трансформация дрожжей кДНК библиотекой.

Проверка взаимодействия двух белков в двугибридной системе.

Поиск автоактиваторов в двугибридной системе.

Растворы, среды, антибиотики, добавки для двугибридной системы.

ПЦР дрожжевых колоний.

Работа с бактериями:

Номенклатура генотипа бактерий.

Бактериальные штаммы для мол. клонирования.

Хранение бактериальных штаммов.

Трансформация бактерий.

Электропорация.

Бактериальные штаммы для мол. клонирования (Word 2000).

Гибридизация бактериальных колоний с радиоактивным зондом.

Выделение pDNA:

Выделение pDNA (минипреп).

Выделение pDNA (максипреп).

Экспресс метод выделения pDNA.

Очистка pDNA равновесным центрифугированием в CsCl.

Получение одноцепочечной DNA:

Амплификация и хранение хелперных фагов.

Выделение одноцепочечной ДНК.

наверх

Работа с фагом лямбда:

Выделение ДНК фага лямбда.

Выделение ДНК фага лямбда для приготовления вектора.

Выщепление pSK(-) из лямбда ZAP in vivo.

Электрофорез:

Агарозный гель-электрофорез.

Заливка агарозного геля.

Щелочной агарозный гель.

Перенос по Southern (щелочной).

Перенос по Southern (в буфере с высокой ионной силой).

DNA Маркеры.

Выделение ДНК из агарозного геля с помощью...

PEG/TAE.

LMP-агарозы.

диализного мешка.

DEAE - мембраны.

центрифугирования.

наверх

Клонирование:

Осаждение DNA (RNA) этанолом.

Другие методы осаждения DNA(RNA) - PEG, Zn, CTAB.

Мутагенез с помощью Gene Editor system.

Лигирование.

Свойства DNA полимераз.

Свойства DNA полимераз (Word 2000).

Несистематизированные методики:

Спектрофотометрическое измерение концентрации.

Реакция Random primer.

Определение процента включения.

Изготовление G-50 spin-колонок.

Олигонуклеотиды:

Олигонуклеотиды.

Отжиг адаптеров.

Форез олигонуклеотидов.

наверх

PCR:

Состав PCR реакции.

Параметры PCR реакции.

Влияние различных веществ на PCR.

Борьба с загрязнениями при PCR.

Приготовление Т вектора.

Cиквенс:

Cиквенсовая реакция.

Приготовление сиквенсового геля и форез.

Сиквенсовая реакция с использованием CycleReader Kit.

Приготовление сиквенсового геля и форез. Прибор фирмы BioRad.

Выделение DNA из эукариот:

Выделение геномной ДНК из культуры клеток.

Выделение ДНК из крови.

Фенольный метод выделения DNA из мух.

Выделение DNA из мух c DEPC.

Выделение геномной ДНК из растений.

Выделение геномной ДНК из хвостов мышей.

наверх

Работа с RNA:

Выделение RNA из культур клеток.

Препарирование мышки.

Выделение RNA из тканей мыши.

Выделение RNA из мух (фенольный метод).

Очистка polyA+ RNA.

Формальдегидный форез RNA - Northern.

Выделение RNA из мух центрифугированием через CsCl.

Выделение RNA из мух (с Протеиназой К).

Синтез RNA in vitro.

Выделение РНК c тризолом.

Библиотеки:

Приготовление геномной библиотеки.

Скрининг фаговой библиотеки.

PCR-гибридизация после первичного скрининга.

наверх

Работа с белками:

PAAG электрофорез белков.

Окрашивание белковых гелей Coomassie R250.

Окрашивание белковых гелей Zn/имидазолом.

Окрашивание белковых гелей серебром.

Определение концентрации белка на 3ММ.

Высушивание гелей без гель-драера.

Bicinchoninic acid protein assay kit.

Western блоттинг.

Dot-blot для определения рабочей концентрации антител.

PAAG электрофорез нативных белков.

Осаждение белков трихлоруксусной кислотой.

Высушивание гелей на пяльцах.

Высушивание гелей на рамке.

Окрашивание белковых гелей Coomassie R250 с метанолом.

Экспрессия белков:

Определение активности полимеразы.

Очистка Taq полимеразы (клон pTp4).

Очистка Pfu полимеразы (клон pETpfu в BL21(DE3)pLysS).

Очистка His6-меченного белка на Ni-NTA колонке (me(y)2).

Частота встречаемости кодонов в различных организмах.

Проверка взаимодействия двух белков на глютатион-сефарозе.

Работа с культурами эукариотических клеток:

Базовые методы.

наверх

Иммуногистохимия и in situ гибридизация:

Обработка стекол.

In situ гибридизация на политенных хромосомах.

Фиксация и заливка в парафин (дрозофила).

Иммуноокрашивание срезов имаго (дрозофила).

Иммуноокрашивание политенных хромосом.

Гибридизация in situ на срезах с mRNA (дрозофила).

Получение серийных делеций:

Получение серийных делеций с помощью Exo III/MB nuclease.

Получение серийных делеций с DNase I.

Анализ профилей экспрессии:

Random primer на polyA+ RNA.

Мечение total RNA с oligo(dT) праймера.

Обработка фильтров перед первой гибридизацией.

Работа с D. melanogaster:

Приготовление корма для мух.

Разведение в больших количествах.

Сбор эмбрионов D.melanogaster.

Выделение ядерного экстракта из мух.

Выделение ядерного экстракта из небольшого количества мух.

наверх

Растворы:

Обучение:

Приготовление растворов.

Способы выражения концентраций растворов.

Использование комбинированных pH электродов.

Плотности:

Плотности жидкостей.

Плотности растворов солей.

Плотности растворов кислот, оснований и органических веществ.

Прописи:

Соли (первая часть)

Соли (вторая часть)

Однокомпонентные растворы.

Антибиотики (биологические свойства).

Антибиотики (стоковые растворы).

Среды и добавки.

Многокомпонентные растворы.

наверх

Расчеты:

Нуклеотидные последовательности:

Операции с нуклеотидной последовательностью.

Трансляция нуклеотидной последовательности.

Поиск редких кодонов в кодирующей последовательности.

Расчёты:

Расчёт концентрации нуклеиновых кислот по оптической плотности

Пересчёт скорости вращения в ускорение.

Вычисление времени роста бактерий.

Связь биологического количества dNTP’s с радиоактивностью.

Конверсия:

Конверсия: масса - моли (для белков).

Конверсия: масса - моли (для нукл. кислот).

Конверсия ДНК/белок.

Пересчёт молярного количества в молярную концентрацию.

Конверсия единиц измерения.

наверх

Обзоры:

Обзоры биологических web-ресурсов:

Молекулярно-биологические Web-ресурсы.

NCBI (National Center for Biotechnology Information).

BioMail.

Биологическая секция Соросовского Образовательного Журнала.

Семинары группы экспрессии генов:

Инициация транскрипции РНК полимеразой II.

DPE промотор.

Методы детекции SNP.

Структура хроматина и транскрипция.

Обзор программы Vector NTI Suite:

Приложения в составе Vector NTI Suite.

Работа с Gel Display Window.

Конструирование молекул.

ПЦР анализ при помощи Vector NTI.

Дизайн молекул.

Расширенный дизайн молекул.

Инструменты Vector NTI и Интернет.

Обзор программы Visual Cloning 2000:

Возможности Visual Cloning 2000.

Первый опыт работы с Visual Cloning.

Visual Cloning – работаем с Интернет.

Обзор полезных программ.

Книги А.А. Любищева:

Проблемы формы систематики эволюции организмов.

наверх

Обучение:

Результативная работа.

Работа со студентами (аспирантами).

Лаб-минимум.

Правила выживания в лаборатории.

Безопасность в лаборатории.

Работа с автоматической пипеткой.

Работа с ферментами.

Стерильная работа.

Что значит "освоить методику".

Что такое хорошо и что такое плохо.

наверх

Биологические журналы.

Гранты биологического профиля.

Русскоязычные институты биологического профиля:

Российская Академия наук.

Региональные отделения РАН.

Не входящие в РАН.

Национальные Академии наук Беларуси и Украины.

Компании биологического профиля:

Российские компании.

Иностранные компании.

Полезные web-ресурсы:

Союз образовательных сайтов.

наверх

Download:

Site "Practical Molecular Biology":

English and Russian version ( Zip file, size - 6Mb).

English version only ( Zip file, size - 1Mb).

"Практическая Молекулярная Биология" 2000-2005
http://molbiol.edu.ru