Практическая Молекулярная Биология - главная страница.
 > Справочник > Свойства нуклеотидов и нукл. кислот.

Нуклеотиды, нуклеиновые кислоты.


Химическая структура нуклеотидов.

Химическая структура нуклеотидов


Обозначения полиморфных нуклеотидов.

    СимволОбозначаетОбъяснение
    GGGuanine
    AAAdenine
    TTThymine
    CCCytosine
    RA или GpuRine
    YC или TpYrimidine
    MA или CaMino
    KG или TKeto
    SC или Gсильное /Strong/ взаимодействие - три
    водородные связи
    WA или Tслабое /Weak/ взаимодействие - две
    водородные связи
    H(A, C, T) но не GH следует за G в алфавите
    B(C, G, T) но не AB следует за A в алфавите
    V(A, C, G) но не T(U)V следует за T(U) в алфавите
    D(A, G, T) но не CD следует за C в алфавите
    N(A, G, C, T)любое основание / Nucleotide

    Молекулярный вес нуклеиновых киcлот.

    base= 324.5Da
    base pair = 649Da
    ribo base = 340.5Da
    1kb ds DNA (Na) = 6.5x105Da
    1kb ss DNA (Na) = 3.3x105Da
    1kb ss RNA (Na) = 3.4x105Da
    размер: на 1Angstrom приходятся 1.05 оснований.

    Конверсия: масса -> моли (NA).

    1µg/ml DNA = 3.08µM фосфатов
    1µg/ml 1kb фрагмента = 3.08nM 5’-концов
    1µg 1kb фрагмента = 1.54pmol = 9.3x1011молекул
    1µg 1kb фрагмента = 3.03pmol 5’-концов
    1pmol 1kb фрагмента = 0.65µg

    Форма поможет пересчитать массу в моли и обратно. Объяснение принципа работы формы и подробная инструкция откроется в новом окне при нажатии на эту кнопку:   

    Можно восстановить   

     
       Длина НК [kb]:    
    Mw для "olig" [kDa]:   
    Перевод массы в моли:
              
      молекул   
    Перевод молей в массу:
              
      молекул   

    Вычисление молярной концентрации:
       в   

     

    Вычисление количества по концентрации:
       в   

     

    Пересчёт молярного количества в молярную концентрацию.

    Объяснение принципа работы формы и подробная инструкция откроется в новом окне при нажатии на эту кнопку:   

    Можно восстановить   

     
    Расчёт молярной концентрации (M) по молярному количеству (mol).
       в   

     
    Расчёт молярного количества (mol) по молярной концентрации (M).
       в   

     

    Конверсия ДНК/белок.

    1kb DNA --> 333AA, 37kDA
    270bp DNA --> 10kDA
    1.35kb DNA --> 50kDA
    2.7kb DNA --> 100kDA

    На сайте есть удобная программа "Трансляция нуклеотидной последовательности". Она транслирует в любых рамках считывания, с выравниванием или без. Простые манипуляции с нуклеотидной последовательностью (чтение в обратную сторону, чтение комплементарной, перевод в двухцепочечную) можно выполнить с помощью другой программы "Операции с нуклеотидной последовательностью". Для поиска редких кодонов можно использовать форму "Поиск редких кодонов в кодирующей последовательности".


    Можно восстановить   

    Перевод ДНК --> белок:
     [kb]       [kDa]    AA
    Перевод белок --> ДНК:
     [kDa]       [kb]


"Практическая Молекулярная Биология" http://molbiol.edu.ru
e-mail: pmb@molbiol.edu.ru


Rambler's Top100