Главная
  Программа "МКБ"
  Новости
  Справочник
  Рестриктазы
  Методы
  Растворы
  Расчеты
  Обзоры
  Обучение
  Ссылки
  Скачать сайт
  Написать письмо
  О проекте

   English version
  
  
Практическая молекулярная биология

18.11.08 Объявлен новый конкурс по программе "Молекулярная и клеточная биология"...
17.10.08 Отчет по программе МКБ до 31 октября 2008 года...
10.04.08 Программа МКБ. Окончательные результаты конкурса...
10.04.08 Программа МКБ. Результаты по Сибирскому отделению РАН...
28.03.08 Программа МКБ. Информация от экспертной комиссии №2...
24.03.08 Завершился конкурс по программе "Молекулярная и клеточная биология"...


18.11.08 Объявлен новый конкурс по программе "Молекулярная и клеточная биология" (МКБ 2008)...

Научный совет Программы МКБ Президиума РАН объявляет конкурс на 2009-2013 гг. для существующих подразделения РАН и на 2009-2011 гг. для Новых групп. Финансирование на 2009 г. еще не утверждено Президиумом РАН, но оно, по крайней мере, не должно быть уменьшено.

Как обычно, для полноценного проведения конкурса остается очень мало времени. Поэтому мы вынуждены ограничить срок подачи заявок 8 декабря 2008 г. Краткое объявление в Поиске появится, вероятно, в конце этой или следующей недели. По сравнению с проектом правила претерпели небольшие изменения (число требуемых копий - 2, необходимо указать подачу заявок на другие программы Президиума или Отделений РАН и др.). Вся информация о ходе конкурса будет, как всегда сразу приводиться на официальном сайте Программы: www.molbiol.edu.ru, за которым следует регулярно следить.

Вся информация в этом Word файле.


17.10.08 Отчет по программе МКБ до 31 октября 2008 года...

Вся информация в этом Pdf файле.


10.04.08 Программа МКБ. Окончательные результаты конкурса...

Вся информация в этом Word файле.


10.04.08 Программа МКБ. Результаты по Сибирскому отделению РАН...

Председателю СО РАН академику Н.Л.Добрецову

Таблица с результатами в этом Word файле.


28.03.08 Программа МКБ. Информация от Экспертной комиссии №2...

Вся информация в этом Word файле.


24.03.08 Завершился конкурс по программе "Молекулярная и клеточная биология"...

17 марта 2008 года завершился конкурс по Программе "Молекулярная и клеточная биология". С 1 марта по 17 марта 2008 года на конкурс поступило всего 24 проекта. Проведен обсчет всех поступивших проектов, результаты которого приводятся ниже. В настоящее время эти проекты проходят экспертизу. Списки победителей конкурса с учетом экспертной оценки будут опубликованы после 2 апреля 2008 года.

Все результаты в этом Word файле.




Справочник:
   Единицы измерения.
   Аминокислоты, белки.
   Нуклеотиды, нуклеиновые кислоты.
   Свойства и состав живых организмов.
   Радиоизотопы и флуорофоры.
   Центрифугирование.
   Гибридизация.
   Рестриктазы.

 наверх


Методы:

   Двугибридная система:
   Экспресс метод выделения pDNA из дрожжей.
   Анализ активации репортерного гена LacZ.
   Трансформация дрожжей плазмидной ДНК.
   Выделение плазмидной ДНК из дрожжей на колонках.
   Трансформация дрожжей кДНК библиотекой.
   Проверка взаимодействия двух белков в двугибридной системе.
   Поиск автоактиваторов в двугибридной системе.
   Растворы, среды, антибиотики, добавки для двугибридной системы.
   ПЦР дрожжевых колоний.

     Работа с бактериями:
   Номенклатура генотипа бактерий.
   Бактериальные штаммы для мол. клонирования.
   Хранение бактериальных штаммов.
   Трансформация бактерий.
   Электропорация.
    Бактериальные штаммы для мол. клонирования (Word 2000).
   Гибридизация бактериальных колоний с радиоактивным зондом.

   Выделение pDNA:
   Выделение pDNA (минипреп).
   Выделение pDNA (максипреп).
   Экспресс метод выделения pDNA.
   Очистка pDNA равновесным центрифугированием в CsCl.

   Получение одноцепочечной DNA:
   Амплификация и хранение хелперных фагов.
   Выделение одноцепочечной ДНК.

    наверх

   Работа с фагом лямбда:
   Выделение ДНК фага лямбда.
   Выделение ДНК фага лямбда для приготовления вектора.
   Выщепление pSK(-) из лямбда ZAP in vivo.

   Электрофорез:

   Агарозный гель-электрофорез.
   Заливка агарозного геля.
   Щелочной агарозный гель.
   Перенос по Southern (щелочной).
   Перенос по Southern (в буфере с высокой ионной силой).
   DNA Маркеры.

   Выделение ДНК из агарозного геля с помощью...
   PEG/TAE.
   glass milk.
   LMP-агарозы.
   диализного мешка.
   DEAE - мембраны.
   центрифугирования.

    наверх

   Клонирование:

   Осаждение DNA (RNA) этанолом.
   Другие методы осаждения DNA(RNA) - PEG, Zn, CTAB.
   Мутагенез с помощью Gene Editor system.
   Лигирование.
   Свойства DNA полимераз.
    Свойства DNA полимераз (Word 2000).

   Несистематизированные методики:
   Спектрофотометрическое измерение концентрации.
   Реакция Random primer.
   Определение процента включения.
   Изготовление G-50 spin-колонок.

   Олигонуклеотиды:
   Олигонуклеотиды.
   Отжиг адаптеров.
   Форез олигонуклеотидов.

    наверх

   PCR:
   Состав PCR реакции.
   Параметры PCR реакции.
   Влияние различных веществ на PCR.
   Борьба с загрязнениями при PCR.
   Приготовление Т вектора.

   Cиквенс:
   Cиквенсовая реакция.
   Приготовление сиквенсового геля и форез.
   Сиквенсовая реакция с использованием CycleReader Kit.
   Приготовление сиквенсового геля и форез. Прибор фирмы BioRad.

     Выделение DNA из эукариот:
   Выделение геномной ДНК из культуры клеток.
   Выделение ДНК из крови.
   Фенольный метод выделения DNA из мух.
   Выделение DNA из мух c DEPC.
   Выделение геномной ДНК из растений.
   Выделение геномной ДНК из хвостов мышей.

    наверх

   Работа с RNA:
   Выделение RNA из культур клеток.
   Препарирование мышки.
   Выделение RNA из тканей мыши.
   Выделение RNA из мух (фенольный метод).
   Очистка polyA+ RNA.
   Формальдегидный форез RNA - Northern.
   Выделение RNA из мух центрифугированием через CsCl.
   Выделение RNA из мух (с Протеиназой К).
   Синтез RNA in vitro.
   Выделение РНК c тризолом.

   Библиотеки:
   Приготовление геномной библиотеки.
   Скрининг фаговой библиотеки.
   PCR-гибридизация после первичного скрининга.

    наверх

   Работа с белками:
   PAAG электрофорез белков.
   Окрашивание белковых гелей Coomassie R250.
   Окрашивание белковых гелей Zn/имидазолом.
   Окрашивание белковых гелей серебром.
   Определение концентрации белка на 3ММ.
   Высушивание гелей без гель-драера.
   Bicinchoninic acid protein assay kit.
   Western блоттинг.
   Dot-blot для определения рабочей концентрации антител.
   PAAG электрофорез нативных белков.
   Осаждение белков трихлоруксусной кислотой.
   Высушивание гелей на пяльцах.
   Высушивание гелей на рамке.
   Окрашивание белковых гелей Coomassie R250 с метанолом.

   Экспрессия белков:
   Определение активности полимеразы.
   Очистка Taq полимеразы (клон pTp4).
   Очистка Pfu полимеразы (клон pETpfu в BL21(DE3)pLysS).
   Очистка His6-меченного белка на Ni-NTA колонке (me(y)2).
   Частота встречаемости кодонов в различных организмах.
   Проверка взаимодействия двух белков на глютатион-сефарозе.

   Работа с культурами эукариотических клеток:
   Базовые методы.

    наверх

   Иммуногистохимия и in situ гибридизация:
   Обработка стекол.
   In situ гибридизация на политенных хромосомах.
   Фиксация и заливка в парафин (дрозофила).
   Иммуноокрашивание срезов имаго (дрозофила).
   Иммуноокрашивание политенных хромосом.
   Гибридизация in situ на срезах с mRNA (дрозофила).

   Получение серийных делеций:
   Получение серийных делеций с помощью Exo III/MB nuclease.
   Получение серийных делеций с DNase I.

   Анализ профилей экспрессии:
   Random primer на polyA+ RNA.
   Мечение total RNA с oligo(dT) праймера.
   Обработка фильтров перед первой гибридизацией.

   Работа с D. melanogaster:
   Приготовление корма для мух.
   Разведение в больших количествах.
   Сбор эмбрионов D.melanogaster.
   Выделение ядерного экстракта из мух.
   Выделение ядерного экстракта из небольшого количества мух.

 наверх

  Растворы:

   Обучение:
   Приготовление растворов.
   Способы выражения концентраций растворов.
   Использование комбинированных pH электродов.

   Плотности:
   Плотности жидкостей.
   Плотности растворов солей.
   Плотности растворов кислот, оснований и органических веществ.

   Прописи:
   Соли (первая часть)
   Соли (вторая часть)
   Однокомпонентные растворы.
   Антибиотики (биологические свойства).
   Антибиотики (стоковые растворы).
   Среды и добавки.
   Многокомпонентные растворы.

 наверх

Расчеты:

   Нуклеотидные последовательности:
   Операции с нуклеотидной последовательностью.
   Трансляция нуклеотидной последовательности.
   Поиск редких кодонов в кодирующей последовательности.

   Расчёты:
   Расчёт концентрации нуклеиновых кислот по оптической плотности
   Пересчёт скорости вращения в ускорение.
   Вычисление времени роста бактерий.
   Связь биологического количества dNTP’s с радиоактивностью.

   Конверсия:
   Конверсия: масса - моли (для белков).
   Конверсия: масса - моли (для нукл. кислот).
   Конверсия ДНК/белок.
   Пересчёт молярного количества в молярную концентрацию.
   Конверсия единиц измерения.

 наверх

Обзоры:

   Обзоры биологических web-ресурсов:
   Молекулярно-биологические Web-ресурсы.
   NCBI (National Center for Biotechnology Information).
   BioMail.
   Биологическая секция Соросовского Образовательного Журнала.

   Семинары группы экспрессии генов:
   Инициация транскрипции РНК полимеразой II.
   DPE промотор.
   Методы детекции SNP.
   Структура хроматина и транскрипция.

     Обзор программы Vector NTI Suite:
   Приложения в составе Vector NTI Suite.
   Работа с Gel Display Window.
   Конструирование молекул.
   ПЦР анализ при помощи Vector NTI.
   Дизайн молекул.
   Расширенный дизайн молекул.
   Инструменты Vector NTI и Интернет.

   Обзор программы Visual Cloning 2000:
   Возможности Visual Cloning 2000.
   Первый опыт работы с Visual Cloning.
   Visual Cloning – работаем с Интернет.

   Обзор полезных программ.

   Книги А.А. Любищева:
   Проблемы формы систематики эволюции организмов.

 наверх

Обучение:

   Результативная работа.
   Работа со студентами (аспирантами).
   Лаб-минимум.
   Правила выживания в лаборатории.
   Безопасность в лаборатории.
   Работа с автоматической пипеткой.
   Работа с ферментами.
   Стерильная работа.
   Что значит "освоить методику".
   Что такое хорошо и что такое плохо.

 наверх

Cсылки:

   Биологические журналы.

   Гранты биологического профиля.

   Русскоязычные институты биологического профиля:
   Российская Академия наук.
   Региональные отделения РАН.
   Не входящие в РАН.
   Национальные Академии наук Беларуси и Украины.

   Компании биологического профиля:
   Российские компании.
   Иностранные компании.

   Полезные web-ресурсы:
    Союз образовательных сайтов.

 наверх

Download:

   Site "Practical Molecular Biology":
      English and Russian version ( Zip file, size - 6Mb).
      English version only ( Zip file, size - 1Mb).










"Практическая Молекулярная Биология" 2000-2005
http://molbiol.edu.ru


Rambler's Top100 Бесплатные библиотеки сети Каталог медицинских ресурсов